Решение об учреждении именных премий Правительства Санкт-Петербурга и Санкт-Петербургского научного центра Российской академии наук за выдающиеся научные результаты в области науки и техники было принято на совместном заседании Правительства Санкт-Петербурга и Президиума СПбНЦ РАН в июне 1999 года. Первоначально премии присуждались один раз в два года. В 2000 году первые петербургские учёные стали лауреатами премий в области физико-математических наук (премия имени А.Ф. Иоффе), в области физиологии и медицины (премия имени И.П. Павлова) и в области гуманитарных и общественных наук (премия имени С.Ф. Ольденбурга). В следующем году присуждались премии в области химических наук (премия имени Д.И. Менделеева), в области наук о Земле (премия имени А.П. Карпинского) и в области технических наук (премия имени А.Н. Крылова). С 2003 года все премии стали ежегодными, а с 2006 года, количество номинаций стало расширяться. С 2022 года производится вручение 21 премии по 17 номинациям (с 2018 года по двум номинациям для молодых учёных – премии имени Л. Эйлера и Е.Р. Дашковой вручается по три премии).
В данном разделе приводится подробная информация о научных премиях и их лауреатах с 2000 года по настоящее время, а также краткие сведения об учёных Санкт-Петербурга, ставших лауреатами Нобелевских премий.